Net als zijn tweelingbroer Kevin heeft Jonathan Borlée geen finaleplaats kunnen bemachtigen op de individuele baanronde. In de derde van drie halve finales strandde hij op de vijfde plaats in 45″23. Enkel de eerste twee finishers in elke wedstrijd en de drie tijdsnelsten mogen zich opmaken voor de eindstrijd. Voor de finale was uiteindelijk 44″64 vereist.
Ondanks een vrij stevige start verloor Jonathan Borlée al snel voeling met de snelsten in zijn wedstrijd. De Botswaan Makwala en de Jamaicaan Gaye liepen uit, maar ook de Amerikaan Robert leek al gaan vliegen. De Belgische recordhouder kon nog beroep doen op een aardig eindschot maar het bleef bij een vijfde plek in 45″23, de zestiende tijd van alle deelnemers.